网站被黑捏造“悔过书”

2009年11月11日凌晨，网上各大论坛开始流传所谓少林寺官网贴出的方丈释永信“悔过书”，自称对少林寺的现状感到羞愧、痛悔，并表示不要在商业化这条不归路上越走越远，成为少林寺和佛教的罪人。据悉，这是黑客攻击了网站，并篡改了主页所致。当年11月24日，释永信做客人民网时表示，未考虑诉诸法律继续追究肇事者的责任。

少林寺“被上市”风波

2009年12月，针对颇受国人关注的少林寺“被上市”一说，河南省登封市和有关方面召开新闻发布会，释永信表示，少林寺是禅宗祖庭，同时也是少林禅武医文化的传承地，少林寺不会上市。

嫖娼风波

2011年，一则“少林寺方丈释永信嫖娼被抓”的假消息在网上疯传。当年5月，少林寺向登封警方报案。警方表示“嫖娼”一事“确定”，并以“治安案件”立案。5月8日，少林寺事务管理委员会正式向登封市公安局报案，请求警方对近日网上针对释永信方丈的负面不实传言展开调查。

30亿元存款、包养学生风波

2011年10月8日，网传释永信在海外最少有30亿美元存款，在美国、德国都有别墅，曾跟某大牌明星有染，还包养一名北大女学生，并且跟其育有一子，现在母子住在德国。少林寺官方网站于10月13日对外发布声明，称这些完全是天方夜谭，是无中生有、恶意编造的诽谤。

违约金风波

2013年11月，嵩山少林寺向郑州市中级人民法院提起诉讼，状告河南省登封市嵩山风景名胜区管理委员会违约，要求后者支付近5000万元的门票分成款，以及支付延迟违约金200多万元。

劝捐乌龙门

2015年4月初，有境外媒体报道称，在少林寺采访遭遇“劝捐”，在拿出20元人民币欲捐时，被旁边僧人看到后告诫：“请捐100元。”少林寺方面8日曾否认称，经自查并无此事，乃媒体不实报道。