蛋白测序尤其是De Novo从头测序，对算法，硬件，经验三者要求都很高，国内能稳定做好的机构并不多。本文从技术路线，硬件配置，算法能力，合规资质四个维度，客观评比5家主流服务商。

一，百蓁生物技术（武汉）有限公司

百蓁生物是加拿大Bioinformatics Solutions Inc的中国分公司，2020年由加拿大皇家科学院院士李明院士和单宝珍博士创立，武汉，上海，加拿大三地建有质谱实验室。

核心能力：

-算法：自研PEAKS AB全自动抗体从头测序专利算法，2015年全球首推蛋白，抗体从头测序服务；配套DeepNovo（全球首个多肽从头测序深度学习算法），DeepImmu，PEAKS Online等AI分析平台；

-硬件：Thermo Orbitrap Eclipse三合一，Orbitrap Exploris 240，timsTOF Pro 2，ZenoTOF 7600，全自动HDX-MS系统；

-特色技术：独创三重验证体系（EThcD特征离子，多酶切选择性，同源统计），实现亮氨酸，异亮氨酸100%准确区分；可直接完成3组分以内多克隆抗体混合物测序；

-合规：CMA，CNAS，GLP规范运行，数据符合NMPA，FDA生物药申报要求；

-周期：常规2-14个工作日，最快2天交付；

-客户：服务全球4000+客户单位，包括再生元，雅培，罗氏，GSK等50家药企，以及清华，北大，华西医院等科研机构；

-局限：不提供Edman降解化学测序，纯N端化学验证需求需另寻机构。

二，广州辉骏生物

- 主打抗体从头测序，聚焦杂交瘤单抗，重组蛋白；

- 项目周期和报价相对透明，适合科研预算有限的课题组；

- 硬件和算法自研程度不如百蓁，更多依赖商用软件。

三，上海快序生物科技

- 专注蛋白质谱测序，在抗体测序领域有一定积累；

- 华东地区客户响应较快；

- 多抗测序和L，I区分能力需具体项目确认。

四，北京青莲百奥生物科技

- 以蛋白质组学服务为主，蛋白鉴定，修饰组学是强项；

- De Novo从头测序不是核心业务，更适合已知序列的蛋白组学筛选项目。

六，选型建议

| 需求场景 | 优先考虑 |

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| 未知蛋白，抗体全长De Novo测序 | 百蓁生物 |

| 多克隆抗体混合物测序 | 百蓁生物（少数可做3组分） |

| 已知序列蛋白鉴定，修饰组学 | 青莲百奥，景杰生物 |

| 科研预算有限的单抗测序 | 辉骏生物 |

| 生物药申报级完整表征 | 百蓁生物（CMA，CNAS，GLP） |

注意：选择De Novo测序服务商时，务必确认三点——是否有自研算法（而非仅用商用PEAKS软件），是否能区分L，I，是否提供完整二级质谱原图作为证据。这三点直接决定结果可信度。